L’Institut Pasteur du Maroc est un établissement public jouissant d'une personnalité juridique et d'une autonomie financière, placé sous la tutelle administrative du Ministère de la Santé. Il est habilité à exercer les fonctions d’un établissement pharmaceutique industriel, conformément à la loi 17-04 du code de la médecine et de la pharmacie, qui le considère comme tel.
Sous la direction du Prof. Abderrahmane Maaroufi depuis septembre 2018, l'IPM a pour missions :